Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1D8

PRO2289, Putative uncharacterized protein PRO2289, humanhuman

Predictions only

Length 64 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRO2289Q9P1D8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PRO2289Q9P1D8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms