Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U3

SENP1, Sentrin-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1Q9P0U3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms