Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms