Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ1

COA4, Cytochrome c oxidase assembly factor 4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COA4Q9NYJ1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COA4Q9NYJ1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms