Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNK4Q9NYG8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms