Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FAM53CQ9NYF3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM53CQ9NYF3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM53CQ9NYF3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM53CQ9NYF3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM53CQ9NYF3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM53CQ9NYF3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM53CQ9NYF3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM53CQ9NYF3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM53CQ9NYF3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM53CQ9NYF3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM53CQ9NYF3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM53CQ9NYF3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM53CQ9NYF3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM53CQ9NYF3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM53CQ9NYF3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM53CQ9NYF3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM53CQ9NYF3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM53CQ9NYF3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM53CQ9NYF3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM53CQ9NYF3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM53CQ9NYF3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM53CQ9NYF3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM53CQ9NYF3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM53CQ9NYF3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM53CQ9NYF3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM53CQ9NYF3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM53CQ9NYF3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM53CQ9NYF3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM53CQ9NYF3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM53CQ9NYF3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM53CQ9NYF3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM53CQ9NYF3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM53CQ9NYF3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM53CQ9NYF3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM53CQ9NYF3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM53CQ9NYF3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM53CQ9NYF3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM53CQ9NYF3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM53CQ9NYF3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM53CQ9NYF3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM53CQ9NYF3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM53CQ9NYF3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM53CQ9NYF3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM53CQ9NYF3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM53CQ9NYF3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM53CQ9NYF3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM53CQ9NYF3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM53CQ9NYF3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM53CQ9NYF3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM53CQ9NYF3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM53CQ9NYF3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM53CQ9NYF3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM53CQ9NYF3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM53CQ9NYF3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM53CQ9NYF3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM53CQ9NYF3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM53CQ9NYF3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms