Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA2D2Q9NY47 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms