Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAJC28Q9NX36 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAJC28Q9NX36 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms