Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDIT4Q9NX09 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDIT4Q9NX09 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDIT4Q9NX09 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDIT4Q9NX09 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DDIT4Q9NX09 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDIT4Q9NX09 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDIT4Q9NX09 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDIT4Q9NX09 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDIT4Q9NX09 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDIT4Q9NX09 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DDIT4Q9NX09 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDIT4Q9NX09 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDIT4Q9NX09 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDIT4Q9NX09 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDIT4Q9NX09 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDIT4Q9NX09 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDIT4Q9NX09 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDIT4Q9NX09 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDIT4Q9NX09 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDIT4Q9NX09 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDIT4Q9NX09 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DDIT4Q9NX09 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DDIT4Q9NX09 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDIT4Q9NX09 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDIT4Q9NX09 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDIT4Q9NX09 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DDIT4Q9NX09 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDIT4Q9NX09 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDIT4Q9NX09 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDIT4Q9NX09 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDIT4Q9NX09 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDIT4Q9NX09 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDIT4Q9NX09 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDIT4Q9NX09 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDIT4Q9NX09 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDIT4Q9NX09 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDIT4Q9NX09 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DDIT4Q9NX09 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDIT4Q9NX09 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDIT4Q9NX09 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDIT4Q9NX09 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDIT4Q9NX09 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDIT4Q9NX09 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDIT4Q9NX09 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDIT4Q9NX09 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDIT4Q9NX09 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDIT4Q9NX09 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDIT4Q9NX09 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DDIT4Q9NX09 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DDIT4Q9NX09 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DDIT4Q9NX09 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDIT4Q9NX09 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
DDIT4Q9NX09 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms