Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ASF1BQ9NVP2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms