Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM30AQ9NV96 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM30AQ9NV96 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms