Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUS5

AP5S1, AP-5 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5S1Q9NUS5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP5S1Q9NUS5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP5S1Q9NUS5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms