Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATP8A2Q9NTI2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP8A2Q9NTI2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms