Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOPORSQ9NS56 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TOPORSQ9NS56 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TOPORSQ9NS56 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOPORSQ9NS56 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOPORSQ9NS56 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOPORSQ9NS56 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOPORSQ9NS56 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOPORSQ9NS56 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOPORSQ9NS56 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOPORSQ9NS56 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOPORSQ9NS56 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOPORSQ9NS56 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOPORSQ9NS56 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOPORSQ9NS56 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOPORSQ9NS56 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOPORSQ9NS56 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOPORSQ9NS56 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOPORSQ9NS56 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOPORSQ9NS56 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOPORSQ9NS56 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms