Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW3

APOBEC3C, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3C, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3CQ9NRW3 ARL6IP1-203ENST00000562234 391 ntTSL 518.7■□□□□ 0.589e-9■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.379e-9■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 ARL6IP1-208ENST00000569976 778 ntTSL 216.04■□□□□ 0.169e-9■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 ATP6AP1-207ENST00000455205 4515 ntTSL 214.96□□□□□ -0.019e-9■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 ATP6AP1-210ENST00000619046 2823 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.529e-9■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 ARL6IP1-204ENST00000562819 578 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.139e-9■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 ARL6IP1-205ENST00000563861 948 ntTSL 1 (best)6.35□□□□□ -1.399e-9■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5J2-PTCD1-202ENST00000437572 544 ntTSL 417.99■□□□□ 0.471e-7■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5J2-PTCD1-203ENST00000451138 331 ntTSL 417.27■□□□□ 0.361e-7■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 PTCD1-204ENST00000430982 571 ntTSL 416.47■□□□□ 0.231e-7■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.121e-7■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5J2-206ENST00000466753 774 ntTSL 213.77□□□□□ -0.211e-7■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5J2-204ENST00000414062 541 ntTSL 411.44□□□□□ -0.581e-7■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5J2-202ENST00000359832 323 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.931e-7■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5J2-203ENST00000394186 305 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.061e-7■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5J2-201ENST00000292475 607 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.081e-7■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5J2-205ENST00000449683 460 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.251e-7■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.641e-7■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.412e-14■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.712e-14■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 RPL8-206ENST00000528296 540 ntTSL 318.75■□□□□ 0.592e-14■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 RPL8-209ENST00000529920 876 ntTSL 218.55■□□□□ 0.562e-14■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.52e-14■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 RPL8-213ENST00000533397 730 ntTSL 218.01■□□□□ 0.472e-14■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 RPL8-204ENST00000526668 717 ntTSL 1 (best)17.29■□□□□ 0.362e-14■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.242e-14■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 RPL8-214ENST00000534781 716 ntTSL 216.13■□□□□ 0.172e-14■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 RPL8-211ENST00000531975 698 ntTSL 313.57□□□□□ -0.242e-14■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 RPL8-208ENST00000529163 556 ntTSL 212.6□□□□□ -0.392e-14■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 PRDX1-206ENST00000483583 530 ntTSL 224.66■■□□□ 1.547e-15■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 PRDX1-204ENST00000424390 795 ntTSL 215.26■□□□□ 0.037e-15■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 PRDX1-205ENST00000447184 606 ntTSL 58.79□□□□□ -17e-15■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 PTMA-210ENST00000467816 378 ntTSL 214.42□□□□□ -0.15e-10■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 PPP1R35-204ENST00000487452 965 ntTSL 230.27■■■□□ 2.443e-10■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 PPP1R35-205ENST00000491407 942 ntTSL 529.9■■■□□ 2.383e-10■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.33e-10■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 PPP1R35-203ENST00000476185 474 ntTSL 222.41■■□□□ 1.183e-10■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 EIF4G1-233ENST00000475721 1271 ntTSL 221.89■■□□□ 1.093e-10■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 PPP1R35-202ENST00000470295 758 ntTSL 221.55■■□□□ 1.043e-10■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 EIF4G1-230ENST00000460829 1804 ntTSL 220.53■□□□□ 0.883e-10■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.183e-10■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.13e-10■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.093e-10■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.093e-10■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.083e-10■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.033e-10■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.13e-10■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.133e-10■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 EIF4G1-222ENST00000442406 5129 ntTSL 1 (best)14.18□□□□□ -0.143e-10■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.163e-10■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.213e-10■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.233e-10■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 PSAP-204ENST00000495196 344 ntTSL 213.41□□□□□ -0.264e-6■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.333e-10■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 EIF4G1-221ENST00000441154 4311 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.673e-10■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 PFDN5-217ENST00000552548 497 ntTSL 27.43□□□□□ -1.223e-10■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 B2M-207ENST00000559907 499 ntTSL 315.47■□□□□ 0.075e-9■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 B2M-206ENST00000559720 1220 ntTSL 510.24□□□□□ -0.775e-9■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 B2M-201ENST00000349264 732 ntTSL 36.53□□□□□ -1.365e-9■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.914e-9■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 NME1-210ENST00000512768 1056 ntTSL 1 (best)19.03■□□□□ 0.644e-9■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 NME1-208ENST00000487481 987 ntTSL 217.09■□□□□ 0.334e-9■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 NME1-205ENST00000465188 521 ntTSL 29.72□□□□□ -0.854e-9■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 NME1-204ENST00000456492 510 ntTSL 25.46□□□□□ -1.544e-9■□□□□ 10
APOBEC3CQ9NRW3 ARF1-209ENST00000478424 1059 ntTSL 227.42■■□□□ 1.981e-11■□□□□ 9.9
APOBEC3CQ9NRW3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.381e-11■□□□□ 9.9
APOBEC3CQ9NRW3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.511e-11■□□□□ 9.9
APOBEC3CQ9NRW3 ARF1-201ENST00000272102 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.571e-11■□□□□ 9.9
APOBEC3CQ9NRW3 PTMA-211ENST00000468027 621 ntTSL 1 (best)14.12□□□□□ -0.153e-10■□□□□ 9.9
APOBEC3CQ9NRW3 SLC25A3-207ENST00000547869 1018 ntTSL 24.27□□□□□ -1.731e-10■□□□□ 9.9
APOBEC3CQ9NRW3 CALR-204ENST00000586967 394 ntTSL 215.69■□□□□ 0.14e-15■□□□□ 9.9
APOBEC3CQ9NRW3 FBL-210ENST00000599159 1400 ntTSL 1 (best)24.35■■□□□ 1.493e-13■□□□□ 9.9
APOBEC3CQ9NRW3 FBL-203ENST00000594309 603 ntTSL 223.94■■□□□ 1.423e-13■□□□□ 9.9
APOBEC3CQ9NRW3 FBL-209ENST00000599134 500 ntTSL 522.85■■□□□ 1.253e-13■□□□□ 9.9
APOBEC3CQ9NRW3 FBL-208ENST00000598417 581 ntTSL 520.66■□□□□ 0.93e-13■□□□□ 9.9
APOBEC3CQ9NRW3 FBL-207ENST00000597634 726 ntTSL 516.74■□□□□ 0.273e-13■□□□□ 9.9
APOBEC3CQ9NRW3 B2M-210ENST00000560681 572 ntTSL 416.67■□□□□ 0.263e-13■□□□□ 9.9
APOBEC3CQ9NRW3 B2M-208ENST00000559916 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.593e-13■□□□□ 9.9
APOBEC3CQ9NRW3 B2M-203ENST00000557901 407 ntTSL 1 (best)8.75□□□□□ -1.013e-13■□□□□ 9.9
APOBEC3CQ9NRW3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.521e-6■□□□□ 9.9
APOBEC3CQ9NRW3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.671e-6■□□□□ 9.9
APOBEC3CQ9NRW3 RPL24-205ENST00000488288 1857 ntTSL 210.17□□□□□ -0.781e-14■□□□□ 9.9
APOBEC3CQ9NRW3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.115e-9■□□□□ 9.9
APOBEC3CQ9NRW3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.435e-9■□□□□ 9.9
APOBEC3CQ9NRW3 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.325e-9■□□□□ 9.9
APOBEC3CQ9NRW3 RBBP7-206ENST00000425696 373 ntTSL 56.52□□□□□ -1.375e-9■□□□□ 9.9
APOBEC3CQ9NRW3 RBBP7-208ENST00000465244 4031 ntTSL 26.39□□□□□ -1.395e-9■□□□□ 9.9
APOBEC3CQ9NRW3 RBBP7-201ENST00000330735 858 ntTSL 23.5□□□□□ -1.855e-9■□□□□ 9.9
APOBEC3CQ9NRW3 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.074e-9■□□□□ 9.9
APOBEC3CQ9NRW3 LDHA-207ENST00000460405 680 ntTSL 311.2□□□□□ -0.625e-11■□□□□ 9.9
APOBEC3CQ9NRW3 LDHA-214ENST00000536528 516 ntTSL 37.41□□□□□ -1.225e-11■□□□□ 9.9
APOBEC3CQ9NRW3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.725e-9■□□□□ 9.8
APOBEC3CQ9NRW3 POLR2L-202ENST00000534030 585 ntTSL 421.09■□□□□ 0.974e-7■□□□□ 9.8
APOBEC3CQ9NRW3 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 04e-7■□□□□ 9.8
APOBEC3CQ9NRW3 PSMB7-206ENST00000498485 967 ntTSL 515.78■□□□□ 0.121e-6■□□□□ 9.8
APOBEC3CQ9NRW3 PSMB7-201ENST00000259457 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.641e-6■□□□□ 9.8
APOBEC3CQ9NRW3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 11e-6■□□□□ 9.8
APOBEC3CQ9NRW3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.911e-6■□□□□ 9.8
APOBEC3CQ9NRW3 OAZ1-203ENST00000586054 2832 nt19.97■□□□□ 0.791e-6■□□□□ 9.8
APOBEC3CQ9NRW3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.691e-6■□□□□ 9.8
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