Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNNM1Q9NRU3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNNM1Q9NRU3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNNM1Q9NRU3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNNM1Q9NRU3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNNM1Q9NRU3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNNM1Q9NRU3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNNM1Q9NRU3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNNM1Q9NRU3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNNM1Q9NRU3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNNM1Q9NRU3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNNM1Q9NRU3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNNM1Q9NRU3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNNM1Q9NRU3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNNM1Q9NRU3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNNM1Q9NRU3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNNM1Q9NRU3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNNM1Q9NRU3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNNM1Q9NRU3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CNNM1Q9NRU3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNNM1Q9NRU3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNNM1Q9NRU3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNNM1Q9NRU3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNNM1Q9NRU3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNNM1Q9NRU3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNNM1Q9NRU3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CNNM1Q9NRU3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNNM1Q9NRU3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNNM1Q9NRU3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNNM1Q9NRU3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CNNM1Q9NRU3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNNM1Q9NRU3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNNM1Q9NRU3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNNM1Q9NRU3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNNM1Q9NRU3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNNM1Q9NRU3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNNM1Q9NRU3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNNM1Q9NRU3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNNM1Q9NRU3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNNM1Q9NRU3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNNM1Q9NRU3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNNM1Q9NRU3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNNM1Q9NRU3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNNM1Q9NRU3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNNM1Q9NRU3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNNM1Q9NRU3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNNM1Q9NRU3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNNM1Q9NRU3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNNM1Q9NRU3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNNM1Q9NRU3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNNM1Q9NRU3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNNM1Q9NRU3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CNNM1Q9NRU3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNNM1Q9NRU3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CNNM1Q9NRU3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CNNM1Q9NRU3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms