Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ3

CCL28, C-C motif chemokine 28, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL28Q9NRJ3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL28Q9NRJ3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL28Q9NRJ3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL28Q9NRJ3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL28Q9NRJ3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL28Q9NRJ3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL28Q9NRJ3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL28Q9NRJ3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL28Q9NRJ3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL28Q9NRJ3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL28Q9NRJ3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL28Q9NRJ3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL28Q9NRJ3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL28Q9NRJ3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL28Q9NRJ3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL28Q9NRJ3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL28Q9NRJ3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL28Q9NRJ3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL28Q9NRJ3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL28Q9NRJ3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL28Q9NRJ3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL28Q9NRJ3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL28Q9NRJ3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL28Q9NRJ3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL28Q9NRJ3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL28Q9NRJ3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL28Q9NRJ3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL28Q9NRJ3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL28Q9NRJ3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL28Q9NRJ3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL28Q9NRJ3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL28Q9NRJ3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL28Q9NRJ3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL28Q9NRJ3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL28Q9NRJ3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL28Q9NRJ3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL28Q9NRJ3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL28Q9NRJ3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL28Q9NRJ3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL28Q9NRJ3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL28Q9NRJ3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL28Q9NRJ3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL28Q9NRJ3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL28Q9NRJ3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL28Q9NRJ3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL28Q9NRJ3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL28Q9NRJ3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL28Q9NRJ3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL28Q9NRJ3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL28Q9NRJ3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL28Q9NRJ3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL28Q9NRJ3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCL28Q9NRJ3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL28Q9NRJ3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL28Q9NRJ3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL28Q9NRJ3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL28Q9NRJ3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL28Q9NRJ3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL28Q9NRJ3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL28Q9NRJ3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL28Q9NRJ3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL28Q9NRJ3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL28Q9NRJ3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL28Q9NRJ3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL28Q9NRJ3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL28Q9NRJ3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL28Q9NRJ3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL28Q9NRJ3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL28Q9NRJ3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL28Q9NRJ3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL28Q9NRJ3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL28Q9NRJ3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL28Q9NRJ3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL28Q9NRJ3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL28Q9NRJ3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL28Q9NRJ3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL28Q9NRJ3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL28Q9NRJ3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL28Q9NRJ3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL28Q9NRJ3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL28Q9NRJ3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL28Q9NRJ3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL28Q9NRJ3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL28Q9NRJ3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL28Q9NRJ3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL28Q9NRJ3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL28Q9NRJ3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL28Q9NRJ3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL28Q9NRJ3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL28Q9NRJ3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL28Q9NRJ3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL28Q9NRJ3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL28Q9NRJ3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL28Q9NRJ3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL28Q9NRJ3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL28Q9NRJ3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL28Q9NRJ3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL28Q9NRJ3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL28Q9NRJ3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL28Q9NRJ3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms