Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG0

CHRAC1, Chromatin accessibility complex protein 1, humanhuman

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Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRAC1Q9NRG0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRAC1Q9NRG0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRAC1Q9NRG0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRAC1Q9NRG0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRAC1Q9NRG0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRAC1Q9NRG0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRAC1Q9NRG0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHRAC1Q9NRG0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHRAC1Q9NRG0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHRAC1Q9NRG0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHRAC1Q9NRG0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
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