Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTPS2Q9NRF8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTPS2Q9NRF8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTPS2Q9NRF8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTPS2Q9NRF8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTPS2Q9NRF8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTPS2Q9NRF8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTPS2Q9NRF8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTPS2Q9NRF8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTPS2Q9NRF8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTPS2Q9NRF8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTPS2Q9NRF8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTPS2Q9NRF8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTPS2Q9NRF8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms