Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR56

MBNL1, Muscleblind-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBNL1Q9NR56 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MBNL1Q9NR56 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBNL1Q9NR56 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBNL1Q9NR56 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBNL1Q9NR56 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBNL1Q9NR56 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBNL1Q9NR56 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBNL1Q9NR56 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBNL1Q9NR56 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBNL1Q9NR56 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBNL1Q9NR56 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBNL1Q9NR56 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MBNL1Q9NR56 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MBNL1Q9NR56 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBNL1Q9NR56 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBNL1Q9NR56 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBNL1Q9NR56 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBNL1Q9NR56 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBNL1Q9NR56 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBNL1Q9NR56 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBNL1Q9NR56 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBNL1Q9NR56 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBNL1Q9NR56 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBNL1Q9NR56 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBNL1Q9NR56 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBNL1Q9NR56 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBNL1Q9NR56 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBNL1Q9NR56 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBNL1Q9NR56 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBNL1Q9NR56 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBNL1Q9NR56 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBNL1Q9NR56 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBNL1Q9NR56 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBNL1Q9NR56 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MBNL1Q9NR56 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBNL1Q9NR56 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBNL1Q9NR56 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBNL1Q9NR56 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MBNL1Q9NR56 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MBNL1Q9NR56 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MBNL1Q9NR56 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MBNL1Q9NR56 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MBNL1Q9NR56 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MBNL1Q9NR56 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MBNL1Q9NR56 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MBNL1Q9NR56 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MBNL1Q9NR56 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MBNL1Q9NR56 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MBNL1Q9NR56 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MBNL1Q9NR56 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MBNL1Q9NR56 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MBNL1Q9NR56 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MBNL1Q9NR56 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MBNL1Q9NR56 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MBNL1Q9NR56 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MBNL1Q9NR56 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MBNL1Q9NR56 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MBNL1Q9NR56 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MBNL1Q9NR56 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MBNL1Q9NR56 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MBNL1Q9NR56 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MBNL1Q9NR56 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MBNL1Q9NR56 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MBNL1Q9NR56 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MBNL1Q9NR56 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MBNL1Q9NR56 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MBNL1Q9NR56 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MBNL1Q9NR56 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MBNL1Q9NR56 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MBNL1Q9NR56 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MBNL1Q9NR56 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MBNL1Q9NR56 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MBNL1Q9NR56 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MBNL1Q9NR56 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MBNL1Q9NR56 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MBNL1Q9NR56 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MBNL1Q9NR56 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MBNL1Q9NR56 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MBNL1Q9NR56 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MBNL1Q9NR56 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MBNL1Q9NR56 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MBNL1Q9NR56 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MBNL1Q9NR56 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MBNL1Q9NR56 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MBNL1Q9NR56 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MBNL1Q9NR56 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MBNL1Q9NR56 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MBNL1Q9NR56 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MBNL1Q9NR56 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MBNL1Q9NR56 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MBNL1Q9NR56 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MBNL1Q9NR56 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MBNL1Q9NR56 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MBNL1Q9NR56 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MBNL1Q9NR56 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MBNL1Q9NR56 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MBNL1Q9NR56 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MBNL1Q9NR56 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MBNL1Q9NR56 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MBNL1Q9NR56 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms