Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
C8orf4Q9NR00 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
C8orf4Q9NR00 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms