Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RTN4Q9NQC3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RTN4Q9NQC3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RTN4Q9NQC3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms