Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MEPEQ9NQ76 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MEPEQ9NQ76 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MEPEQ9NQ76 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MEPEQ9NQ76 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MEPEQ9NQ76 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MEPEQ9NQ76 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MEPEQ9NQ76 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MEPEQ9NQ76 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MEPEQ9NQ76 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MEPEQ9NQ76 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MEPEQ9NQ76 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MEPEQ9NQ76 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MEPEQ9NQ76 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MEPEQ9NQ76 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MEPEQ9NQ76 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MEPEQ9NQ76 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MEPEQ9NQ76 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MEPEQ9NQ76 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MEPEQ9NQ76 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms