Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE2

NGRN, Neugrin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGRNQ9NPE2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NGRNQ9NPE2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NGRNQ9NPE2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NGRNQ9NPE2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NGRNQ9NPE2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NGRNQ9NPE2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NGRNQ9NPE2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NGRNQ9NPE2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NGRNQ9NPE2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NGRNQ9NPE2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NGRNQ9NPE2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NGRNQ9NPE2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NGRNQ9NPE2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NGRNQ9NPE2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NGRNQ9NPE2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NGRNQ9NPE2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NGRNQ9NPE2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NGRNQ9NPE2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NGRNQ9NPE2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NGRNQ9NPE2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NGRNQ9NPE2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NGRNQ9NPE2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NGRNQ9NPE2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NGRNQ9NPE2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NGRNQ9NPE2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NGRNQ9NPE2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NGRNQ9NPE2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NGRNQ9NPE2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NGRNQ9NPE2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NGRNQ9NPE2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NGRNQ9NPE2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NGRNQ9NPE2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NGRNQ9NPE2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NGRNQ9NPE2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NGRNQ9NPE2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NGRNQ9NPE2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NGRNQ9NPE2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NGRNQ9NPE2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NGRNQ9NPE2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NGRNQ9NPE2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NGRNQ9NPE2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NGRNQ9NPE2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NGRNQ9NPE2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NGRNQ9NPE2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NGRNQ9NPE2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NGRNQ9NPE2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NGRNQ9NPE2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NGRNQ9NPE2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NGRNQ9NPE2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NGRNQ9NPE2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NGRNQ9NPE2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NGRNQ9NPE2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NGRNQ9NPE2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NGRNQ9NPE2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NGRNQ9NPE2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NGRNQ9NPE2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NGRNQ9NPE2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NGRNQ9NPE2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NGRNQ9NPE2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NGRNQ9NPE2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NGRNQ9NPE2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NGRNQ9NPE2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NGRNQ9NPE2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NGRNQ9NPE2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NGRNQ9NPE2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NGRNQ9NPE2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NGRNQ9NPE2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NGRNQ9NPE2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NGRNQ9NPE2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NGRNQ9NPE2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NGRNQ9NPE2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NGRNQ9NPE2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NGRNQ9NPE2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NGRNQ9NPE2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NGRNQ9NPE2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NGRNQ9NPE2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NGRNQ9NPE2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NGRNQ9NPE2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NGRNQ9NPE2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NGRNQ9NPE2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NGRNQ9NPE2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NGRNQ9NPE2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NGRNQ9NPE2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NGRNQ9NPE2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NGRNQ9NPE2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NGRNQ9NPE2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NGRNQ9NPE2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NGRNQ9NPE2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NGRNQ9NPE2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NGRNQ9NPE2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NGRNQ9NPE2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NGRNQ9NPE2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NGRNQ9NPE2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NGRNQ9NPE2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NGRNQ9NPE2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NGRNQ9NPE2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NGRNQ9NPE2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NGRNQ9NPE2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NGRNQ9NPE2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NGRNQ9NPE2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms