Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD3

EXOSC4, Exosome complex component RRP41, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC4Q9NPD3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
EXOSC4Q9NPD3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms