Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC3

CCNB1IP1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNB1IP1Q9NPC3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCNB1IP1Q9NPC3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCNB1IP1Q9NPC3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCNB1IP1Q9NPC3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms