Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms