Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLXNA4Q9HCM2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLXNA4Q9HCM2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms