Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VAT1LQ9HCJ6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VAT1LQ9HCJ6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VAT1LQ9HCJ6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VAT1LQ9HCJ6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VAT1LQ9HCJ6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VAT1LQ9HCJ6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VAT1LQ9HCJ6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VAT1LQ9HCJ6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VAT1LQ9HCJ6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VAT1LQ9HCJ6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VAT1LQ9HCJ6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VAT1LQ9HCJ6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VAT1LQ9HCJ6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VAT1LQ9HCJ6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VAT1LQ9HCJ6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VAT1LQ9HCJ6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VAT1LQ9HCJ6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VAT1LQ9HCJ6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VAT1LQ9HCJ6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VAT1LQ9HCJ6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
VAT1LQ9HCJ6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
VAT1LQ9HCJ6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VAT1LQ9HCJ6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VAT1LQ9HCJ6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VAT1LQ9HCJ6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VAT1LQ9HCJ6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VAT1LQ9HCJ6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VAT1LQ9HCJ6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VAT1LQ9HCJ6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
VAT1LQ9HCJ6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VAT1LQ9HCJ6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VAT1LQ9HCJ6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VAT1LQ9HCJ6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VAT1LQ9HCJ6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VAT1LQ9HCJ6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VAT1LQ9HCJ6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VAT1LQ9HCJ6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VAT1LQ9HCJ6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VAT1LQ9HCJ6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VAT1LQ9HCJ6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VAT1LQ9HCJ6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VAT1LQ9HCJ6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VAT1LQ9HCJ6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VAT1LQ9HCJ6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VAT1LQ9HCJ6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VAT1LQ9HCJ6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VAT1LQ9HCJ6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VAT1LQ9HCJ6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VAT1LQ9HCJ6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VAT1LQ9HCJ6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VAT1LQ9HCJ6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VAT1LQ9HCJ6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VAT1LQ9HCJ6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VAT1LQ9HCJ6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VAT1LQ9HCJ6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VAT1LQ9HCJ6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VAT1LQ9HCJ6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VAT1LQ9HCJ6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VAT1LQ9HCJ6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
VAT1LQ9HCJ6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VAT1LQ9HCJ6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VAT1LQ9HCJ6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VAT1LQ9HCJ6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VAT1LQ9HCJ6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VAT1LQ9HCJ6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VAT1LQ9HCJ6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VAT1LQ9HCJ6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VAT1LQ9HCJ6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VAT1LQ9HCJ6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VAT1LQ9HCJ6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VAT1LQ9HCJ6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VAT1LQ9HCJ6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
VAT1LQ9HCJ6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VAT1LQ9HCJ6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VAT1LQ9HCJ6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VAT1LQ9HCJ6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VAT1LQ9HCJ6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VAT1LQ9HCJ6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VAT1LQ9HCJ6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VAT1LQ9HCJ6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VAT1LQ9HCJ6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VAT1LQ9HCJ6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VAT1LQ9HCJ6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VAT1LQ9HCJ6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VAT1LQ9HCJ6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VAT1LQ9HCJ6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VAT1LQ9HCJ6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VAT1LQ9HCJ6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VAT1LQ9HCJ6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VAT1LQ9HCJ6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VAT1LQ9HCJ6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VAT1LQ9HCJ6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
VAT1LQ9HCJ6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VAT1LQ9HCJ6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VAT1LQ9HCJ6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VAT1LQ9HCJ6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VAT1LQ9HCJ6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VAT1LQ9HCJ6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VAT1LQ9HCJ6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms