Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
APOBEC3GQ9HC16 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
APOBEC3GQ9HC16 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC3GQ9HC16 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms