Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBI1

PARVB, Beta-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVBQ9HBI1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PARVBQ9HBI1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms