Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7T0

CATSPERB, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPERBQ9H7T0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CATSPERBQ9H7T0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CATSPERBQ9H7T0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CATSPERBQ9H7T0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CATSPERBQ9H7T0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CATSPERBQ9H7T0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms