Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I9

LRRC27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC27Q9C0I9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC27Q9C0I9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC27Q9C0I9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC27Q9C0I9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
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