Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LRRCC1Q9C099 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms