Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ROPN1BQ9BZX4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms