Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms