Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
EDEM3Q9BZQ6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms