Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM54Q9BYV2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM54Q9BYV2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms