Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms