Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVC4

MLST8, Target of rapamycin complex subunit LST8, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLST8Q9BVC4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MLST8Q9BVC4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MLST8Q9BVC4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MLST8Q9BVC4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MLST8Q9BVC4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MLST8Q9BVC4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MLST8Q9BVC4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MLST8Q9BVC4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MLST8Q9BVC4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MLST8Q9BVC4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MLST8Q9BVC4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MLST8Q9BVC4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MLST8Q9BVC4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MLST8Q9BVC4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MLST8Q9BVC4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MLST8Q9BVC4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MLST8Q9BVC4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MLST8Q9BVC4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MLST8Q9BVC4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MLST8Q9BVC4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MLST8Q9BVC4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MLST8Q9BVC4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MLST8Q9BVC4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MLST8Q9BVC4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MLST8Q9BVC4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MLST8Q9BVC4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MLST8Q9BVC4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MLST8Q9BVC4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MLST8Q9BVC4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MLST8Q9BVC4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MLST8Q9BVC4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MLST8Q9BVC4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MLST8Q9BVC4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MLST8Q9BVC4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MLST8Q9BVC4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MLST8Q9BVC4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MLST8Q9BVC4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MLST8Q9BVC4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MLST8Q9BVC4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MLST8Q9BVC4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MLST8Q9BVC4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms