Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CRACR2AQ9BSW2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRACR2AQ9BSW2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms