Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSK4

FEM1A, Protein fem-1 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FEM1AQ9BSK4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FEM1AQ9BSK4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FEM1AQ9BSK4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FEM1AQ9BSK4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FEM1AQ9BSK4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FEM1AQ9BSK4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FEM1AQ9BSK4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FEM1AQ9BSK4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FEM1AQ9BSK4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FEM1AQ9BSK4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FEM1AQ9BSK4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FEM1AQ9BSK4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FEM1AQ9BSK4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FEM1AQ9BSK4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FEM1AQ9BSK4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FEM1AQ9BSK4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FEM1AQ9BSK4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FEM1AQ9BSK4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FEM1AQ9BSK4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FEM1AQ9BSK4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FEM1AQ9BSK4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FEM1AQ9BSK4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FEM1AQ9BSK4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FEM1AQ9BSK4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms