Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TINF2Q9BSI4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TINF2Q9BSI4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TINF2Q9BSI4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TINF2Q9BSI4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TINF2Q9BSI4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TINF2Q9BSI4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TINF2Q9BSI4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TINF2Q9BSI4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TINF2Q9BSI4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TINF2Q9BSI4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TINF2Q9BSI4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TINF2Q9BSI4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TINF2Q9BSI4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TINF2Q9BSI4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TINF2Q9BSI4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TINF2Q9BSI4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TINF2Q9BSI4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TINF2Q9BSI4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TINF2Q9BSI4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TINF2Q9BSI4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TINF2Q9BSI4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TINF2Q9BSI4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TINF2Q9BSI4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TINF2Q9BSI4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TINF2Q9BSI4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TINF2Q9BSI4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TINF2Q9BSI4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TINF2Q9BSI4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TINF2Q9BSI4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TINF2Q9BSI4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms