Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE5

AGMAT, Agmatinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGMATQ9BSE5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AGMATQ9BSE5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGMATQ9BSE5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGMATQ9BSE5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
AGMATQ9BSE5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGMATQ9BSE5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGMATQ9BSE5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms