Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GINS3Q9BRX5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms