Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG2

SH2D3A, SH2 domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D3AQ9BRG2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SH2D3AQ9BRG2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SH2D3AQ9BRG2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SH2D3AQ9BRG2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SH2D3AQ9BRG2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH2D3AQ9BRG2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH2D3AQ9BRG2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH2D3AQ9BRG2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH2D3AQ9BRG2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH2D3AQ9BRG2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH2D3AQ9BRG2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH2D3AQ9BRG2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH2D3AQ9BRG2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH2D3AQ9BRG2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH2D3AQ9BRG2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH2D3AQ9BRG2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH2D3AQ9BRG2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH2D3AQ9BRG2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH2D3AQ9BRG2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SH2D3AQ9BRG2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH2D3AQ9BRG2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH2D3AQ9BRG2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH2D3AQ9BRG2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH2D3AQ9BRG2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH2D3AQ9BRG2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH2D3AQ9BRG2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SH2D3AQ9BRG2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH2D3AQ9BRG2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH2D3AQ9BRG2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH2D3AQ9BRG2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH2D3AQ9BRG2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH2D3AQ9BRG2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH2D3AQ9BRG2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH2D3AQ9BRG2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH2D3AQ9BRG2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH2D3AQ9BRG2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH2D3AQ9BRG2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH2D3AQ9BRG2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH2D3AQ9BRG2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SH2D3AQ9BRG2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH2D3AQ9BRG2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SH2D3AQ9BRG2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH2D3AQ9BRG2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH2D3AQ9BRG2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH2D3AQ9BRG2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH2D3AQ9BRG2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH2D3AQ9BRG2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH2D3AQ9BRG2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH2D3AQ9BRG2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH2D3AQ9BRG2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH2D3AQ9BRG2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH2D3AQ9BRG2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH2D3AQ9BRG2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH2D3AQ9BRG2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH2D3AQ9BRG2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SH2D3AQ9BRG2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH2D3AQ9BRG2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH2D3AQ9BRG2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH2D3AQ9BRG2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH2D3AQ9BRG2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH2D3AQ9BRG2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms