Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CITED1Q99966 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED1Q99966 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms