Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LGMNQ99538 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGMNQ99538 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms