Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NAP1L3Q99457 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms