Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL1

UIMC1, BRCA1-A complex subunit RAP80, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UIMC1Q96RL1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UIMC1Q96RL1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UIMC1Q96RL1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UIMC1Q96RL1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UIMC1Q96RL1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UIMC1Q96RL1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
UIMC1Q96RL1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UIMC1Q96RL1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
UIMC1Q96RL1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UIMC1Q96RL1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UIMC1Q96RL1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UIMC1Q96RL1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UIMC1Q96RL1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UIMC1Q96RL1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UIMC1Q96RL1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UIMC1Q96RL1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UIMC1Q96RL1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UIMC1Q96RL1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UIMC1Q96RL1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UIMC1Q96RL1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UIMC1Q96RL1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UIMC1Q96RL1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UIMC1Q96RL1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UIMC1Q96RL1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UIMC1Q96RL1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UIMC1Q96RL1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UIMC1Q96RL1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UIMC1Q96RL1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UIMC1Q96RL1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UIMC1Q96RL1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UIMC1Q96RL1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
UIMC1Q96RL1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UIMC1Q96RL1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UIMC1Q96RL1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UIMC1Q96RL1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UIMC1Q96RL1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UIMC1Q96RL1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UIMC1Q96RL1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UIMC1Q96RL1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UIMC1Q96RL1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UIMC1Q96RL1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UIMC1Q96RL1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UIMC1Q96RL1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UIMC1Q96RL1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UIMC1Q96RL1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UIMC1Q96RL1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UIMC1Q96RL1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UIMC1Q96RL1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms